Los Institutos Primario y Secundarios de la Universidad forman parte del proyecto educativo de la Institución. Atendiendo al logro de una educación integrada ofrece asimismo a los educandos,  una formación espiritual  fundada en los valores cristianos y la doctrina de la Iglesia Católica, y aspiran al desarrollo de auténticas comunidades educativas insertas en distintos ambientes y con diferentes realidades e integradas al proceso social argentino, latinoamericano y mundial.
Los institutos de la Universidad participan activamente en las transformaciones educativas de la Ley Federal de Educación, incorporando paulatinamente las nuevas modalidades y niveles, como así también implementando la reconversión de sus docentes.
Los Institutos, más allá de brindar una educación actualizada a través de sus currículas, ponen el énfasis en las siguientes áreas:

Formación espiritual cristocéntrica  y devoción mariana: la tarea pastoral es impulsada por agentes de pastoral y asistida por sacerdotes capellanes en cada uno de los Institutos, trabajando mancomunadamente con las parroquias respectivas.
Recursos y metodologías orientadas al desarrollo del pensamiento lógico y del juicio crítico, respetando la etapa evolutiva que transiten los educandos.
Enseñanza de computación en laboratorios óptimamente equipados. Utilización de la computación en las diversas áreas curriculares.
Enseñanza del idioma inglés (americano) por niveles.
Orientación y seguimiento del alumno en forma personalizada. Los Institutos cuentan con apoyatura psicopedagógica y orientación vocacional.
Deportes, educación artística y variadas actividades extracurriculares que favorezcan el desarrollo integral de la persona.